O Departamento possui 8 Laboratórios de Pesquisa coordenados pelos docentes do Departamento. A maioria dos laboratórios está localizada no Edifício Sede do Departamento de Zootecnia. Abaixo, os laboratórios em lista.

Laboratórios do Departamento de Zootecnia
Laboratório de Nutrição Animal (LNA)
Laboratório de Nutrição de Ruminantes (LABNUR)
Laboratório de Bioclimatologia Animal
Laboratório Multiusuário de Biologia Muscular e Nutrigenômica
Laboratório de Biotecnologia Animal (LABTEC)
Laboratório de Ciência da Carne (LCC)
Laboratório de Fisiologia e Reprodução Animal
Laboratório de Forragicultura e Microbiologia da Silagem (Labfor)
Laboratório de Informática do Melhoramento Animal
Laboratório de Aquicultura (Laqua)
Laboratório de Informática
Laboratório de Composição Corporal e Densitometria